Skip to Main Content
Table 1.

Epitope-candidate peptides derived from VEGFR1

HLA alleleStart positionAmino acid sequence (mer)Binding scoreHLA alleleStart positionAmino acid sequence (mer)Binding score
A2 1,087 VLLWEIFSL (9) 1,793 A24 913 KYGNLSNYL (9) 576 
A2 770 TLFWLLLTL (9) 182 A24 919 NYLKSKRDL (9) 300 
A2 1,028 ILLSENNVV (9) 179 A24 871 EYKALMTEL (9) 264 
A2 766 CVAATLFWL (9) 137 A24 1,212 RYVNAFKFM (9) 90 
A2 874 ALMTELKIL (9) 75 A24 1,084 SYGVLLWEI (9) 66 
A2 861 KMLKEGATA (9) 47 A24 1,146 RFAELVEKL (9) 64 
A2 875 LMTELKILT (9) 38 A24 821 EFARERLKL (9) 22 
A2 881 ILTHIGHHL (9) 36 A24 754 KSNLELITL (9) 12 
A2 1,027 NILLSENNV (9) 35 A24 819 KWEFARERL (9) 12 
A2 220 YLTHRQTNT (9) 34 A24 814 PYDASKWEF (9) 11 
A2 1,153 KLGDLLQANV (10) 998 A24 919 NYLKSKRDLF (10) 150 
A2 1,029 LLSENNVVKI (10) 167 A24 1,084 SYGVLLWEIF (10) 120 
A2 417 NLTATLIVNV (10) 160 A24 1,001 SYSFQVARGM (10) 35 
A2 1,094 SLGGSPYPGV (10) 104 A24 880 KILTHIGHHL (10) 17 
A2 1,104 QMDEDFCSRL (10) 96 A24 1,003 SFQVARGMEF (10) 17 
A2 1,086 GVLLWEIFSL (10) 92 A24 1,212 RYVNAFKFMS (10) 15 
A2 797 IIMDPDEVPL (10) 76 A24 700 KIQQEPGIIL (10) 12 
A2 1,004 FQVARGMEFL (10) 62 A24 873 KALMTELKIL (10) 12 
A2 220 YLTHRQTNTI (10) 48 A24 1,149 ELVEKLGDLL (10) 
A2 590 ILLRTVNNRT (10) 47 A24 1,079 KSDVWSYGVL (10) 
HLA alleleStart positionAmino acid sequence (mer)Binding scoreHLA alleleStart positionAmino acid sequence (mer)Binding score
A2 1,087 VLLWEIFSL (9) 1,793 A24 913 KYGNLSNYL (9) 576 
A2 770 TLFWLLLTL (9) 182 A24 919 NYLKSKRDL (9) 300 
A2 1,028 ILLSENNVV (9) 179 A24 871 EYKALMTEL (9) 264 
A2 766 CVAATLFWL (9) 137 A24 1,212 RYVNAFKFM (9) 90 
A2 874 ALMTELKIL (9) 75 A24 1,084 SYGVLLWEI (9) 66 
A2 861 KMLKEGATA (9) 47 A24 1,146 RFAELVEKL (9) 64 
A2 875 LMTELKILT (9) 38 A24 821 EFARERLKL (9) 22 
A2 881 ILTHIGHHL (9) 36 A24 754 KSNLELITL (9) 12 
A2 1,027 NILLSENNV (9) 35 A24 819 KWEFARERL (9) 12 
A2 220 YLTHRQTNT (9) 34 A24 814 PYDASKWEF (9) 11 
A2 1,153 KLGDLLQANV (10) 998 A24 919 NYLKSKRDLF (10) 150 
A2 1,029 LLSENNVVKI (10) 167 A24 1,084 SYGVLLWEIF (10) 120 
A2 417 NLTATLIVNV (10) 160 A24 1,001 SYSFQVARGM (10) 35 
A2 1,094 SLGGSPYPGV (10) 104 A24 880 KILTHIGHHL (10) 17 
A2 1,104 QMDEDFCSRL (10) 96 A24 1,003 SFQVARGMEF (10) 17 
A2 1,086 GVLLWEIFSL (10) 92 A24 1,212 RYVNAFKFMS (10) 15 
A2 797 IIMDPDEVPL (10) 76 A24 700 KIQQEPGIIL (10) 12 
A2 1,004 FQVARGMEFL (10) 62 A24 873 KALMTELKIL (10) 12 
A2 220 YLTHRQTNTI (10) 48 A24 1,149 ELVEKLGDLL (10) 
A2 590 ILLRTVNNRT (10) 47 A24 1,079 KSDVWSYGVL (10) 

NOTE: These epitope-candidate peptides were selected with binding prediction software described in Materials and Methods and shown in the order of binding scores reflecting binding affinity of the peptide to the HLAs.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal