Skip to Main Content
Table 1.

Expression analysis of CYP27B1, VDR, and CYP24 employing real-time PCR

OriginSampleCYP27B1
VDR
CYP24
RQVRQV sample/RQV brainRQVRQV sample/RQV brainRQVRQV sample/RQV brain
Biopsy H91 (+)* 2.1e−03 1.8e+00 2.1e−03 3.9e−02 2.0e−03 2.2e+01 
 H220 (+) 2.2e−03 1.9e+00 8.0e−04 1.5e−02 5.7e−03 6.4e+01 
 H246 (+)* 4.7e−03 4.1e+00 3.7e−03 7.0e−02 1.9e−03 2.1e+01 
 H346 (+) 3.1e−02 2.8e+01 1.9e−02 3.6e−01 0.0e+00 0.0e+00 
 H385 (+)* 2.8e−03 2.4e+00 4.1e−03 7.7e−02 0.0e+00 0.0e+00 
 H549 (+) 1.1e−02 9.8e+00 9.1e−03 1.7e−01 5.5e−04 6.1e+00 
 H552 (+) 2.1e−01 1.8e+02 3.9e−03 7.4e−02 2.3e−04 2.5e+00 
 H556 (+) 3.1e−03 2.7e+00 3.0e−03 5.6e−02 9.6e−05 1.1e+00 
 H570 (+) 3.5e−03 3.1e+00 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00 
 H981 (+) 1.1e−02 9.9e+00 1.3e−02 2.5e−01 3.3e−03 3.6e+01 
 H49 (−) 8.2e−03 7.2e+00 1.3e−03 2.5e−02 3.6e−03 4.1e+01 
 H226 (−) 2.5e−02 2.2e+01 0.0e+00 0.0e+00 4.5e−04 5.0e+00 
 H281 (−) 3.2e−02 2.9e+01 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00 
 H282 (−)* 1.3e−01 1.1e+02 5.0e−03 9.5e−02 0.0e+00 0.0e+00 
 H321 (−) 5.5e−05 4.8e−02 2.9e−04 5.5e−03 2.0e−03 2.3e+01 
 H323 (−) 1.6e−03 1.4e+00 0.0e+00 0.0e+00 1.3e−02 1.5e+02 
 H361 (−)* 6.1e−04 5.4e−01 2.0e−03 3.8e−02 0.0e+00 0.0e+00 
 H366 (−)* 1.2e−03 1.1e+00 4.5e−01 8.5e+00 0.0e+00 0.0e+00 
 H545 (−) 8.4e−04 7.4e−01 3.4e−03 6.5e−02 1.7e−02 1.9e+02 
 H546 (−) 1.1e−03 9.6e−01 7.6e−04 1.4e−02 5.4e−05 6.0e−01 
Cell line T3868 (+) 1.6e−02 1.5e+01 3.3e−03 6.3e−02 1.5e−04 1.7e+00 
 TX3868 (+)* 6.8e−02 6.0e+01 5.4e−03 1.0e−01 0.0e+00 0.0e+00 
 H246 (+) 2.2e−02 1.9e+01 1.1e−03 2.2e−02 6.8e−03 7.6e+01 
 H346 (+) 1.3e−02 1.1e+01 1.3e−04 2.5e−03 0.0e+00 0.0e+00 
 H556 (+) 1.3e+00 1.2e+03 0.0e+00 0.0e+00 1.7e−05 1.9e−01 
 T3095 (−) 2.9e−03 2.5e+00 1.3e−04 2.5e−03 0.0e+00 0.0e+00 
 TX3095 (−) 4.7e−04 4.1e−01 3.5e−04 6.7e−03 0.0e+00 0.0e+00 
 H366 (−) 2.5e−01 2.2e+02 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00 
 H545 (−) 5.9e−02 5.2e+01 2.8e−03 5.3e−02 0.0e+00 0.0e+00 
 H546 (−) 2.5e−02 2.2e+01 1.5e−02 2.8e−01 0.0e+00 0.0e+00 
Biopsy Brain 1.1e−03 5.3e−02 9.0e−05 
OriginSampleCYP27B1
VDR
CYP24
RQVRQV sample/RQV brainRQVRQV sample/RQV brainRQVRQV sample/RQV brain
Biopsy H91 (+)* 2.1e−03 1.8e+00 2.1e−03 3.9e−02 2.0e−03 2.2e+01 
 H220 (+) 2.2e−03 1.9e+00 8.0e−04 1.5e−02 5.7e−03 6.4e+01 
 H246 (+)* 4.7e−03 4.1e+00 3.7e−03 7.0e−02 1.9e−03 2.1e+01 
 H346 (+) 3.1e−02 2.8e+01 1.9e−02 3.6e−01 0.0e+00 0.0e+00 
 H385 (+)* 2.8e−03 2.4e+00 4.1e−03 7.7e−02 0.0e+00 0.0e+00 
 H549 (+) 1.1e−02 9.8e+00 9.1e−03 1.7e−01 5.5e−04 6.1e+00 
 H552 (+) 2.1e−01 1.8e+02 3.9e−03 7.4e−02 2.3e−04 2.5e+00 
 H556 (+) 3.1e−03 2.7e+00 3.0e−03 5.6e−02 9.6e−05 1.1e+00 
 H570 (+) 3.5e−03 3.1e+00 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00 
 H981 (+) 1.1e−02 9.9e+00 1.3e−02 2.5e−01 3.3e−03 3.6e+01 
 H49 (−) 8.2e−03 7.2e+00 1.3e−03 2.5e−02 3.6e−03 4.1e+01 
 H226 (−) 2.5e−02 2.2e+01 0.0e+00 0.0e+00 4.5e−04 5.0e+00 
 H281 (−) 3.2e−02 2.9e+01 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00 
 H282 (−)* 1.3e−01 1.1e+02 5.0e−03 9.5e−02 0.0e+00 0.0e+00 
 H321 (−) 5.5e−05 4.8e−02 2.9e−04 5.5e−03 2.0e−03 2.3e+01 
 H323 (−) 1.6e−03 1.4e+00 0.0e+00 0.0e+00 1.3e−02 1.5e+02 
 H361 (−)* 6.1e−04 5.4e−01 2.0e−03 3.8e−02 0.0e+00 0.0e+00 
 H366 (−)* 1.2e−03 1.1e+00 4.5e−01 8.5e+00 0.0e+00 0.0e+00 
 H545 (−) 8.4e−04 7.4e−01 3.4e−03 6.5e−02 1.7e−02 1.9e+02 
 H546 (−) 1.1e−03 9.6e−01 7.6e−04 1.4e−02 5.4e−05 6.0e−01 
Cell line T3868 (+) 1.6e−02 1.5e+01 3.3e−03 6.3e−02 1.5e−04 1.7e+00 
 TX3868 (+)* 6.8e−02 6.0e+01 5.4e−03 1.0e−01 0.0e+00 0.0e+00 
 H246 (+) 2.2e−02 1.9e+01 1.1e−03 2.2e−02 6.8e−03 7.6e+01 
 H346 (+) 1.3e−02 1.1e+01 1.3e−04 2.5e−03 0.0e+00 0.0e+00 
 H556 (+) 1.3e+00 1.2e+03 0.0e+00 0.0e+00 1.7e−05 1.9e−01 
 T3095 (−) 2.9e−03 2.5e+00 1.3e−04 2.5e−03 0.0e+00 0.0e+00 
 TX3095 (−) 4.7e−04 4.1e−01 3.5e−04 6.7e−03 0.0e+00 0.0e+00 
 H366 (−) 2.5e−01 2.2e+02 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00 
 H545 (−) 5.9e−02 5.2e+01 2.8e−03 5.3e−02 0.0e+00 0.0e+00 
 H546 (−) 2.5e−02 2.2e+01 1.5e−02 2.8e−01 0.0e+00 0.0e+00 
Biopsy Brain 1.1e−03 5.3e−02 9.0e−05 

NOTE: Values provided represent means from duplicate assays from the same sample. (+), amplification of the CYP27B1 gene.(−), absence of amplification. RQV, relative quantification value.

*

CYP27B1 expression previously analyzed employing conventional RT-PCR (12).

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal