Skip to Main Content
Table 1

Results from methylation and LOH studies in medulloblastomaa

For methylation studies, % Top band is the proportion of total signal present in the band representing methylation inclusive of N2–4. For LOH studies, YNZ22 and D17S849 are chromosome arm 17p markers.

Sample% Top bandLOH YNZLOH 849OutcomeRisk group
M 01 Tumor 56% − ND Dead Poor 
M 02 Tumor 66% − ND Dead Poor 
M 04 Tumor − − Alive Good 
M 07 Tumor Dead Good 
M 08 Tumor 1% Dead Good 
M 11 Tumor 100% − − Dead Poor 
M 12 Tumor 62% Dead Good 
M 13 Tumor 100% − − Alive Good 
M 19 Tumor − − Alive Good 
M 20 Tumor 100% Dead Poor 
M 22 Tumor 100% − − Alive Good 
M 26 Tumor 100% NI Dead Good 
M 28 Tumor 62% NI Dead Poor 
M 31 Tumor 50% − NI Alive Poor 
M 33 Tumor 100% Dead Poor 
M 34 Tumor 67% Dead Good 
M 35 Tumor NI Alive Good 
M 37 Tumor 100% − − Dead Good 
M 38 Tumor 100% NI − Dead Poor 
M 42 Tumor − − Alive Good 
M 44 Tumor 100% − − Alive Good 
M 45 Tumor 100% − − Dead Poor 
M 46 Tumor 100% − − Alive Good 
M 48 Tumor 100% − − Dead Good 
M 49 Tumor 49% − − Dead Poor 
M 50 Tumor Alive Poor 
M 52 Tumor ND Alive Good 
M 53 Tumor 100% − − Dead Poor 
M 54 Tumor Alive Good 
M 55 Tumor − − Alive Poor 
M 56 Tumor 7% Alive Good 
M 57 Tumor 18% NI − Dead Poor 
M 58 Tumor 53% − − Alive Good 
M 59 Tumor 100% NI Alive Good 
M 61 Tumor NI Alive Good 
M 63 Tumor 100% − − Dead Good 
NB 1 14%     
NB 2 14%     
NB 3 3%     
NB 4     
NB 5 33%     
NB 6 10%     
NB 7 25%     
NB 8 25%     
NB 9 21%     
NB 10 11%     
NB 11 3%     
NB 12 16%     
Sample% Top bandLOH YNZLOH 849OutcomeRisk group
M 01 Tumor 56% − ND Dead Poor 
M 02 Tumor 66% − ND Dead Poor 
M 04 Tumor − − Alive Good 
M 07 Tumor Dead Good 
M 08 Tumor 1% Dead Good 
M 11 Tumor 100% − − Dead Poor 
M 12 Tumor 62% Dead Good 
M 13 Tumor 100% − − Alive Good 
M 19 Tumor − − Alive Good 
M 20 Tumor 100% Dead Poor 
M 22 Tumor 100% − − Alive Good 
M 26 Tumor 100% NI Dead Good 
M 28 Tumor 62% NI Dead Poor 
M 31 Tumor 50% − NI Alive Poor 
M 33 Tumor 100% Dead Poor 
M 34 Tumor 67% Dead Good 
M 35 Tumor NI Alive Good 
M 37 Tumor 100% − − Dead Good 
M 38 Tumor 100% NI − Dead Poor 
M 42 Tumor − − Alive Good 
M 44 Tumor 100% − − Alive Good 
M 45 Tumor 100% − − Dead Poor 
M 46 Tumor 100% − − Alive Good 
M 48 Tumor 100% − − Dead Good 
M 49 Tumor 49% − − Dead Poor 
M 50 Tumor Alive Poor 
M 52 Tumor ND Alive Good 
M 53 Tumor 100% − − Dead Poor 
M 54 Tumor Alive Good 
M 55 Tumor − − Alive Poor 
M 56 Tumor 7% Alive Good 
M 57 Tumor 18% NI − Dead Poor 
M 58 Tumor 53% − − Alive Good 
M 59 Tumor 100% NI Alive Good 
M 61 Tumor NI Alive Good 
M 63 Tumor 100% − − Dead Good 
NB 1 14%     
NB 2 14%     
NB 3 3%     
NB 4     
NB 5 33%     
NB 6 10%     
NB 7 25%     
NB 8 25%     
NB 9 21%     
NB 10 11%     
NB 11 3%     
NB 12 16%     
a

M, medulloblastoma; NB, normal brain; +, LOH; −, retained heterozygosity; NI, noninformative because of constitutional homozygosity; ND, not determined.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal