Skip to Main Content
Table 1

The primer sequences used for PCR-SSCP analysis

GenesExonForwardReverseRestriction enzyme
APC              a  1 5′-CACGCAGCTACTCCATTTTT-3′ 5′-TTACAAGAGGAAACACTGAA-3′  
  2 5′-GGTTATTTAGCATTTCATGC-3′ 5′-TCTCTAAAGTCCTTTAAAAA-3′  
  3 5′-GGCATAAGCAGTTACTACAT-3′ 5′-GAGCTCCCGTACACAAGAGT-3′  
  4 5′-GCTCTCACAAGTCCATTGCT-3′ 5′-AAGTCCCCAAATCTAAAAGC-3′  
  5 5′-AAATTAAGTGCTCTTTGTGG-3′ 5′-GGCAGAGCTGTCAGTGTGCA-3′  
  6 5′-ATCTGACTTGATTCTCTTTT-3′ 5′-CACACGCATGTAACAAAAGG-3′  
  7 5′-CGGTTTTGTACATAACGATA-3′ 5′-TTTCCAGGGGCTCACATTCT-3′  
  8 5′-CTTCTAGACTGAGAGTGTCA-3′ 5′-CATAAAGACCGAGTGAGAAC-3′  
  9 5′-GATCTGGCTTTTGGGTATTA-3′ 5′-TTGAAACATGCATTGTGATG-3′ PvuII, Hinfl 
 10 5′-AGCATTATGGCTTAGGTGAC-3′ 5′-ATTATCTGTGGCATTACAAA-3′  
 11 5′-CAGTTTATTCGATTATGGAT-3′ 5′-AGCACCTTAGGAAGTAAATC-3′  
 12 5′-GCCCCTTGATACTACTCT-3′ 5′-AAAAGCCACATCAGAAAT-3′  
 13 5′-AAAAAGGCAGTTAGTATGAA-3′ 5′-TTAATACCAGCTCAGAGAGG-3′  
 14 5′-TTTATAGAAACAGCACTGAA-3′ 5′-CGTTCTAAAGAAACAAACTC-3′ Msp
 15A 5′-TGTCACTAACCACATTTCCT-3′ 5′-AGCTGCTGCGCTCCCCATAG-3′  
 15B 5′-CAGGAGGCTCTGTGGGACAT-3′ 5′-TGCTTACTGCGATGAGATGC-3′  
 15BD 5′-TTTATCAGAAACCTTTGACA-3′ 5′-TTACCATAGCCATCACTACT-3′ HaeIII, Mva
 15DE 5′-GACATGCTCCATGCCTTATG-3′ 5′-CATGGTGTTTCTCTTCATTA-3′ RsaI, Tag
 15EG 5′-GAAGATGACAAGCCTACCAA-3′ 5′-AGAGTCTGCCTCCTGTGTTG-3′ Rsa
 15FH 5′-TTTCTCAAGGTGTAGTTCCT-3′ 5′-TTGCTTCTGCTTGGTGGCAT-3′ Msp
 15HI 5′-TTCTGTCAGCTCCCTGGACA-3′ 5′-TCGGAATCATCTAATAAGTC-3′ Msp
β-Catenin              b  5′-GCTGACCTGATGGAGTTGGA-3′ 5′-GCTACTTGCTCTTGCGTGAA-3′  
GenesExonForwardReverseRestriction enzyme
APC              a  1 5′-CACGCAGCTACTCCATTTTT-3′ 5′-TTACAAGAGGAAACACTGAA-3′  
  2 5′-GGTTATTTAGCATTTCATGC-3′ 5′-TCTCTAAAGTCCTTTAAAAA-3′  
  3 5′-GGCATAAGCAGTTACTACAT-3′ 5′-GAGCTCCCGTACACAAGAGT-3′  
  4 5′-GCTCTCACAAGTCCATTGCT-3′ 5′-AAGTCCCCAAATCTAAAAGC-3′  
  5 5′-AAATTAAGTGCTCTTTGTGG-3′ 5′-GGCAGAGCTGTCAGTGTGCA-3′  
  6 5′-ATCTGACTTGATTCTCTTTT-3′ 5′-CACACGCATGTAACAAAAGG-3′  
  7 5′-CGGTTTTGTACATAACGATA-3′ 5′-TTTCCAGGGGCTCACATTCT-3′  
  8 5′-CTTCTAGACTGAGAGTGTCA-3′ 5′-CATAAAGACCGAGTGAGAAC-3′  
  9 5′-GATCTGGCTTTTGGGTATTA-3′ 5′-TTGAAACATGCATTGTGATG-3′ PvuII, Hinfl 
 10 5′-AGCATTATGGCTTAGGTGAC-3′ 5′-ATTATCTGTGGCATTACAAA-3′  
 11 5′-CAGTTTATTCGATTATGGAT-3′ 5′-AGCACCTTAGGAAGTAAATC-3′  
 12 5′-GCCCCTTGATACTACTCT-3′ 5′-AAAAGCCACATCAGAAAT-3′  
 13 5′-AAAAAGGCAGTTAGTATGAA-3′ 5′-TTAATACCAGCTCAGAGAGG-3′  
 14 5′-TTTATAGAAACAGCACTGAA-3′ 5′-CGTTCTAAAGAAACAAACTC-3′ Msp
 15A 5′-TGTCACTAACCACATTTCCT-3′ 5′-AGCTGCTGCGCTCCCCATAG-3′  
 15B 5′-CAGGAGGCTCTGTGGGACAT-3′ 5′-TGCTTACTGCGATGAGATGC-3′  
 15BD 5′-TTTATCAGAAACCTTTGACA-3′ 5′-TTACCATAGCCATCACTACT-3′ HaeIII, Mva
 15DE 5′-GACATGCTCCATGCCTTATG-3′ 5′-CATGGTGTTTCTCTTCATTA-3′ RsaI, Tag
 15EG 5′-GAAGATGACAAGCCTACCAA-3′ 5′-AGAGTCTGCCTCCTGTGTTG-3′ Rsa
 15FH 5′-TTTCTCAAGGTGTAGTTCCT-3′ 5′-TTGCTTCTGCTTGGTGGCAT-3′ Msp
 15HI 5′-TTCTGTCAGCTCCCTGGACA-3′ 5′-TCGGAATCATCTAATAAGTC-3′ Msp
β-Catenin              b  5′-GCTGACCTGATGGAGTTGGA-3′ 5′-GCTACTTGCTCTTGCGTGAA-3′  

a–b These sequences were previously reported in:

a

Refs. 28 and 29; and

b

Ref. 23.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal