Skip to Main Content
Table 1.

Association of the htSNPs in the TYMS gene with endometrial cancer risk, Shanghai Endometrial Cancer Study, 1997-2003

SNPs at TYMS geneMinor allele frequency in controlsAll subjects
OR per allelePtrendPremenopausal women
OR per allelePtrendPostmenopausal women
OR per allelePtrend
Cases (%)Controls (%)OR (95% CI)Cases (%)Controls (%)OR (95% CI)Cases (%)Controls (%)OR (95% CI)
rs502396 0.280 1,027 1,003    444 386    583 617    
    CC  555 (54.0) 520 (51.8) 1.0   256 (57.7) 206 (53.4) 1.0   299 (51.3) 314 (50.9) 1.0   
    CT  390 (38.0) 406 (40.5) 0.9 (0.7-1.1)   156 (35.1) 151 (39.1) 0.8 (0.6-1.1)   234 (40.1) 255 (41.3) 1.0 (0.8-1.2)   
    TT  82 (8.0) 77 (7.7) 1.0 (0.7-1.4) 1.0 (0.8-1.1) 0.50 32 (7.2) 29 (7.5) 1.0 (0.6-1.6) 0.9 (0.7-1.1) 0.39 50 (8.6) 48 (7.8) 1.1 (0.7-1.7) 1.0 (0.8-1.2) 0.89 
rs2244500 0.310 1,028 1,003    444 386    584 617    
    CC  509 (49.5) 469 (46.8) 1.0   237 (53.4) 192 (49.7) 1.0   272 (46.6) 277 (44.9) 1.0   
    CT  410 (39.9) 444 (44.3) 0.9 (0.7-1.0)   163 (36.7) 162 (42.0) 0.8 (0.6-1.1)   247 (42.3) 282 (45.7) 0.9 (0.7-1.1)   
    TT  109 (10.6) 90 (9.0) 1.1 (0.8-1.5) 1.0 (0.9-1.1) 0.70 44 (9.9) 32 (8.3) 1.2 (0.7-1.9) 1.0 (0.8-1.2) 0.75 65 (11.1) 58 (9.4) 1.1 (0.8-1.7) 1.0 (0.8-1.2) 0.98 
rs3786362 0.188 1,031 1,015    443 386    579 614    
    TT  683 (66.8) 659 (65.9) 1.0   278 (62.8) 245 (63.5) 1.0   405 (70.0) 414 (67.4) 1.0   
    CT  305 (29.8) 306 (30.6) 1.0 (0.8-1.2)   151 (34.1) 126 (32.6) 1.0 (0.8-1.4)   154 (26.6) 180 (29.3) 0.9 (0.7-1.1)   
    CC  34 (3.3) 35 (3.5) 0.9 (0.6-1.5) 1.0 (0.8-1.1) 0.65 14 (3.2) 15 (3.9) 0.9 (0.4-2.0) 1.0 (0.8-1.3) 0.94 20 (3.5) 20 (3.3) 1.0 (0.5-1.9) 0.9 (0.7-1.1) 0.44 
rs2853532 0.317 1,027 1,003    443 386    584 617    
    TT  499 (48.6) 463 (46.2) 1.0   231 (52.1) 188 (48.7) 1.0   268 (45.9) 275 (44.6) 1.0   
    CT  417 (40.6) 444 (44.3) 0.9 (0.7-1.0)   167 (37.7) 165 (42.8) 0.8 (0.6-1.1)   250 (42.8) 279 (45.2) 0.9 (0.7-1.2)   
    CC  111 (10.8) 96 (9.6) 1.1 (0.8-1.4) 1.0 (0.9-1.1) 0.69 45 (10.2) 33 (8.6) 1.2 (0.7-1.9) 1.0 (0.8-1.2) 0.79 66 (11.3) 63 (10.2) 1.1 (0.7-1.6) 1.0 (0.8-1.2) 0.96 
rs3744962 0.158 1,027 1,002    444 386    583 616    
    TT  741 (72.2) 713 (71.2) 1.0   331 (74.6) 289 (74.9) 1.0   410 (70.3) 424 (68.8) 1.0   
    CT  257 (25.0) 260 (26.0) 1.0 (0.8-1.2)   102 (23.0) 89 (23.1) 1.0 (0.7-1.4)   155 (26.6) 171 (27.8) 0.9 (0.7-1.2)   
    CC  29 (2.8) 29 (2.9) 1.0 (0.6-1.6) 1.0 (0.8-1.1) 0.65 11 (2.5) 8 (2.1) 1.2 (0.5-3.0) 1.0 (0.8-1.3) 0.91 18 (3.1) 21 (3.4) 0.9 (0.5-1.7) 0.9 (0.8-1.2) 0.57 
rs11081251 0.309 1,028 1,003    444 386    584 617    
    CC  512 (49.8) 477 (47.6) 1.0   239 (53.8) 194 (50.3) 1.0   273 (46.8) 283 (45.9) 1.0   
    AC  409 (39.8) 432 (43.1) 0.9 (0.7-1.1)   160 (36.0) 160 (41.5) 0.8 (0.6-1.1)   249 (42.6) 272 (44.1) 1.0 (0.7-1.2)   
    AA  107 (10.4) 94 (9.4) 1.1 (0.8-1.4) 1.0 (0.9-1.1) 0.68 45 (10.1) 32 (8.3) 1.2 (0.7-2.0) 1.0 (0.8-1.2) 0.80 62 (10.6) 62 (10.1) 1.0 (0.7-1.5) 1.0 (0.8-1.2) 0.95 
rs9948583 0.320 1,027 1,001    443 386    584 615    
    TT  485 (47.2) 463 (46.3) 1.0   230 (51.9) 191 (49.5) 1.0   255 (43.7) 272 (44.2) 1.0   
    CT  427 (41.6) 436 (43.6) 0.9 (0.8-1.1)   166 (37.5) 161 (41.7) 0.9 (0.6-1.1)   261 (44.7) 275 (44.7) 1.0 (0.8-1.3)   
    CC  115 (11.2) 102 (10.2) 1.1 (0.8-1.4) 1.0 (0.9-1.1) 0.99 47 (10.6) 34 (8.8) 1.2 (0.7-1.9) 1.0 (0.8-1.2) 0.97 68 (11.6) 68 (11.1) 1.1 (0.7-1.6) 1.0 (0.9-1.2) 0.76 
rs3819102 0.237 1,027 1,001    444 386    583 615    
    TT  574 (55.9) 576 (57.5) 1.0   257 (57.9) 213 (55.2) 1.0   317 (54.4) 363 (59.0) 1.0   
    CT  379 (36.9) 376 (37.6) 1.0 (0.8-1.2)   158 (35.6) 154 (39.9) 0.8 (0.6-1.1)   221 (37.9) 222 (36.1) 1.1 (0.9-1.5)   
    CC  74 (7.2) 49 (4.9) 1.5 (1.0-2.2) 1.1 (1.0-1.3) 0.14 29 (6.5) 19 (4.9) 1.3 (0.7-2.3) 1.0 (0.8-1.2) 0.72 45 (7.7) 30 (4.9) 1.7 (1.1-2.8) 1.2 (1.0-1.5) 0.03 
rs10502289 0.154 1,025 1,001    443 386    582 615    
    TT  726 (70.8) 721 (72.0) 1.0   307 (69.3) 278 (72.0) 1.0   419 (72.0) 443 (72.0) 1.0   
    AT  271 (26.4) 255 (25.5) 1.1 (0.9-1.3)   121 (27.3) 99 (25.7) 1.1 (0.8-1.5)   150 (25.8) 156 (25.4) 1.0 (0.8-1.3)   
    AA  28 (2.7) 25 (2.5) 1.1 (0.6-1.9) 1.1 (0.9-1.2) 0.53 15 (3.4) 9 (2.3) 1.6 (0.6-3.5) 1.1 (0.9-1.5) 0.39 13 (2.2) 16 (2.6) 0.9 (0.4-1.8) 1.0 (0.8-1.2) 0.90 
rs2298583 0.471 1,027 1,002    443 386    584 616    
    CC  306 (29.8) 282 (28.1) 1.0   115 (26.0) 99 (25.7) 1.0   191 (32.7) 183 (29.7) 1.0   
    CT  504 (49.1) 496 (49.5) 0.9 (0.8-1.1)   226 (51.0) 193 (50.0) 1.0 (0.7-1.3)   278 (47.6) 303 (49.2) 0.9 (0.7-1.1)   
    TT  217 (21.1) 224 (22.4) 0.9 (0.7-1.1) 0.9 (0.8-1.1) 0.36 102 (23.0) 94 (24.4) 0.9 (0.6-1.4) 1.0 (0.8-1.2) 0.66 115 (19.7) 130 (21.1) 0.8 (0.6-1.2) 0.9 (0.8-1.1) 0.27 
rs2298581 0.389 1,024 1,003    441 386    583 617    
    GG  386 (37.7) 375 (37.4) 1.0   149 (33.8) 139 (36.0) 1.0   237 (40.7) 236 (38.3) 1.0   
    CG  485 (47.4) 478 (47.7) 1.0 (0.8-1.2)   218 (49.4) 186 (48.2) 1.1 (0.8-1.4)   267 (45.8) 292 (47.3) 0.9 (0.7-1.2)   
    CC  153 (14.9) 150 (15.0) 1.0 (0.8-1.3) 1.0 (0.9-1.1) 0.92 74 (16.8) 61 (15.8) 1.1 (0.8-1.7) 1.1 (0.9-1.3) 0.54 79 (13.6) 89 (14.4) 0.9 (0.6-1.3) 0.9 (0.8-1.1) 0.39 
SNPs at TYMS geneMinor allele frequency in controlsAll subjects
OR per allelePtrendPremenopausal women
OR per allelePtrendPostmenopausal women
OR per allelePtrend
Cases (%)Controls (%)OR (95% CI)Cases (%)Controls (%)OR (95% CI)Cases (%)Controls (%)OR (95% CI)
rs502396 0.280 1,027 1,003    444 386    583 617    
    CC  555 (54.0) 520 (51.8) 1.0   256 (57.7) 206 (53.4) 1.0   299 (51.3) 314 (50.9) 1.0   
    CT  390 (38.0) 406 (40.5) 0.9 (0.7-1.1)   156 (35.1) 151 (39.1) 0.8 (0.6-1.1)   234 (40.1) 255 (41.3) 1.0 (0.8-1.2)   
    TT  82 (8.0) 77 (7.7) 1.0 (0.7-1.4) 1.0 (0.8-1.1) 0.50 32 (7.2) 29 (7.5) 1.0 (0.6-1.6) 0.9 (0.7-1.1) 0.39 50 (8.6) 48 (7.8) 1.1 (0.7-1.7) 1.0 (0.8-1.2) 0.89 
rs2244500 0.310 1,028 1,003    444 386    584 617    
    CC  509 (49.5) 469 (46.8) 1.0   237 (53.4) 192 (49.7) 1.0   272 (46.6) 277 (44.9) 1.0   
    CT  410 (39.9) 444 (44.3) 0.9 (0.7-1.0)   163 (36.7) 162 (42.0) 0.8 (0.6-1.1)   247 (42.3) 282 (45.7) 0.9 (0.7-1.1)   
    TT  109 (10.6) 90 (9.0) 1.1 (0.8-1.5) 1.0 (0.9-1.1) 0.70 44 (9.9) 32 (8.3) 1.2 (0.7-1.9) 1.0 (0.8-1.2) 0.75 65 (11.1) 58 (9.4) 1.1 (0.8-1.7) 1.0 (0.8-1.2) 0.98 
rs3786362 0.188 1,031 1,015    443 386    579 614    
    TT  683 (66.8) 659 (65.9) 1.0   278 (62.8) 245 (63.5) 1.0   405 (70.0) 414 (67.4) 1.0   
    CT  305 (29.8) 306 (30.6) 1.0 (0.8-1.2)   151 (34.1) 126 (32.6) 1.0 (0.8-1.4)   154 (26.6) 180 (29.3) 0.9 (0.7-1.1)   
    CC  34 (3.3) 35 (3.5) 0.9 (0.6-1.5) 1.0 (0.8-1.1) 0.65 14 (3.2) 15 (3.9) 0.9 (0.4-2.0) 1.0 (0.8-1.3) 0.94 20 (3.5) 20 (3.3) 1.0 (0.5-1.9) 0.9 (0.7-1.1) 0.44 
rs2853532 0.317 1,027 1,003    443 386    584 617    
    TT  499 (48.6) 463 (46.2) 1.0   231 (52.1) 188 (48.7) 1.0   268 (45.9) 275 (44.6) 1.0   
    CT  417 (40.6) 444 (44.3) 0.9 (0.7-1.0)   167 (37.7) 165 (42.8) 0.8 (0.6-1.1)   250 (42.8) 279 (45.2) 0.9 (0.7-1.2)   
    CC  111 (10.8) 96 (9.6) 1.1 (0.8-1.4) 1.0 (0.9-1.1) 0.69 45 (10.2) 33 (8.6) 1.2 (0.7-1.9) 1.0 (0.8-1.2) 0.79 66 (11.3) 63 (10.2) 1.1 (0.7-1.6) 1.0 (0.8-1.2) 0.96 
rs3744962 0.158 1,027 1,002    444 386    583 616    
    TT  741 (72.2) 713 (71.2) 1.0   331 (74.6) 289 (74.9) 1.0   410 (70.3) 424 (68.8) 1.0   
    CT  257 (25.0) 260 (26.0) 1.0 (0.8-1.2)   102 (23.0) 89 (23.1) 1.0 (0.7-1.4)   155 (26.6) 171 (27.8) 0.9 (0.7-1.2)   
    CC  29 (2.8) 29 (2.9) 1.0 (0.6-1.6) 1.0 (0.8-1.1) 0.65 11 (2.5) 8 (2.1) 1.2 (0.5-3.0) 1.0 (0.8-1.3) 0.91 18 (3.1) 21 (3.4) 0.9 (0.5-1.7) 0.9 (0.8-1.2) 0.57 
rs11081251 0.309 1,028 1,003    444 386    584 617    
    CC  512 (49.8) 477 (47.6) 1.0   239 (53.8) 194 (50.3) 1.0   273 (46.8) 283 (45.9) 1.0   
    AC  409 (39.8) 432 (43.1) 0.9 (0.7-1.1)   160 (36.0) 160 (41.5) 0.8 (0.6-1.1)   249 (42.6) 272 (44.1) 1.0 (0.7-1.2)   
    AA  107 (10.4) 94 (9.4) 1.1 (0.8-1.4) 1.0 (0.9-1.1) 0.68 45 (10.1) 32 (8.3) 1.2 (0.7-2.0) 1.0 (0.8-1.2) 0.80 62 (10.6) 62 (10.1) 1.0 (0.7-1.5) 1.0 (0.8-1.2) 0.95 
rs9948583 0.320 1,027 1,001    443 386    584 615    
    TT  485 (47.2) 463 (46.3) 1.0   230 (51.9) 191 (49.5) 1.0   255 (43.7) 272 (44.2) 1.0   
    CT  427 (41.6) 436 (43.6) 0.9 (0.8-1.1)   166 (37.5) 161 (41.7) 0.9 (0.6-1.1)   261 (44.7) 275 (44.7) 1.0 (0.8-1.3)   
    CC  115 (11.2) 102 (10.2) 1.1 (0.8-1.4) 1.0 (0.9-1.1) 0.99 47 (10.6) 34 (8.8) 1.2 (0.7-1.9) 1.0 (0.8-1.2) 0.97 68 (11.6) 68 (11.1) 1.1 (0.7-1.6) 1.0 (0.9-1.2) 0.76 
rs3819102 0.237 1,027 1,001    444 386    583 615    
    TT  574 (55.9) 576 (57.5) 1.0   257 (57.9) 213 (55.2) 1.0   317 (54.4) 363 (59.0) 1.0   
    CT  379 (36.9) 376 (37.6) 1.0 (0.8-1.2)   158 (35.6) 154 (39.9) 0.8 (0.6-1.1)   221 (37.9) 222 (36.1) 1.1 (0.9-1.5)   
    CC  74 (7.2) 49 (4.9) 1.5 (1.0-2.2) 1.1 (1.0-1.3) 0.14 29 (6.5) 19 (4.9) 1.3 (0.7-2.3) 1.0 (0.8-1.2) 0.72 45 (7.7) 30 (4.9) 1.7 (1.1-2.8) 1.2 (1.0-1.5) 0.03 
rs10502289 0.154 1,025 1,001    443 386    582 615    
    TT  726 (70.8) 721 (72.0) 1.0   307 (69.3) 278 (72.0) 1.0   419 (72.0) 443 (72.0) 1.0   
    AT  271 (26.4) 255 (25.5) 1.1 (0.9-1.3)   121 (27.3) 99 (25.7) 1.1 (0.8-1.5)   150 (25.8) 156 (25.4) 1.0 (0.8-1.3)   
    AA  28 (2.7) 25 (2.5) 1.1 (0.6-1.9) 1.1 (0.9-1.2) 0.53 15 (3.4) 9 (2.3) 1.6 (0.6-3.5) 1.1 (0.9-1.5) 0.39 13 (2.2) 16 (2.6) 0.9 (0.4-1.8) 1.0 (0.8-1.2) 0.90 
rs2298583 0.471 1,027 1,002    443 386    584 616    
    CC  306 (29.8) 282 (28.1) 1.0   115 (26.0) 99 (25.7) 1.0   191 (32.7) 183 (29.7) 1.0   
    CT  504 (49.1) 496 (49.5) 0.9 (0.8-1.1)   226 (51.0) 193 (50.0) 1.0 (0.7-1.3)   278 (47.6) 303 (49.2) 0.9 (0.7-1.1)   
    TT  217 (21.1) 224 (22.4) 0.9 (0.7-1.1) 0.9 (0.8-1.1) 0.36 102 (23.0) 94 (24.4) 0.9 (0.6-1.4) 1.0 (0.8-1.2) 0.66 115 (19.7) 130 (21.1) 0.8 (0.6-1.2) 0.9 (0.8-1.1) 0.27 
rs2298581 0.389 1,024 1,003    441 386    583 617    
    GG  386 (37.7) 375 (37.4) 1.0   149 (33.8) 139 (36.0) 1.0   237 (40.7) 236 (38.3) 1.0   
    CG  485 (47.4) 478 (47.7) 1.0 (0.8-1.2)   218 (49.4) 186 (48.2) 1.1 (0.8-1.4)   267 (45.8) 292 (47.3) 0.9 (0.7-1.2)   
    CC  153 (14.9) 150 (15.0) 1.0 (0.8-1.3) 1.0 (0.9-1.1) 0.92 74 (16.8) 61 (15.8) 1.1 (0.8-1.7) 1.1 (0.9-1.3) 0.54 79 (13.6) 89 (14.4) 0.9 (0.6-1.3) 0.9 (0.8-1.1) 0.39 

NOTE: OR: adjusted for age. Additional adjustment for education, menopausal status, diabetes, alcohol consumption, physical activity, and body mass index did not change the results materially.

Pinteraction test was 0.24 between menopausal status and rs3819102 genotypes.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal