Study demographics of the eight SNPs studied in HNPCC patients according to disease expression: affected with CRC (CRC+) and unaffected MMR gene mutation carriers (CRC−)
| CYP1A1 T3810C . | TT (%) . | TC (%) . | CC (%) . | Any C (%) . | P* . | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Subject group (n = 220) | 187 (85) | 29 (13) | 4 (2) | |||||||
| Allele frequency | 0.916 | 0.084 | ||||||||
| CRC+ (n = 118) | 94 (80) | 20 (17) | 4 (3) | 24 (20) | 0.03 | |||||
| CRC− (n = 100) | 91 (91) | 9 (9) | 0 (0) | 9 (9) | ||||||
| OR, 0.39;† 95% CI, 0.17-0.88; P = 0.03 | ||||||||||
| GSTM1 del | WT (%) | Deletion (%) | Any A (%) | P* | ||||||
| Subject group (n = 220) | 99 (45) | N/A | 121 (55) | |||||||
| Allele frequency | 0.450 | 0.550 | ||||||||
| CRC+ (n = 118) | 53 (45) | N/A | 65 (55) | 65 (55) | 0.99 | |||||
| CRC− (n = 100) | 45 (45) | N/A | 55 (55) | 55 (55) | ||||||
| OR, 0.99;† 95% CI, 0.58-1.70; P = 0.99 | ||||||||||
| GSTT1 del | WT (%) | Deletion (%) | Any A (%) | P* | ||||||
| Subject group (n = 220) | 175 (80) | N/A | 45 (20) | |||||||
| Allele frequency | 0.795 | 0.205 | ||||||||
| CRC+ (n = 118) | 93 (79) | N/A | 25 (21) | 25 (21) | 0.83 | |||||
| CRC− (n = 100) | 80 (80) | N/A | 20 (20) | 20 (20) | ||||||
| OR, 0.93;† 95% CI, 0.48-1.80; P = 0.96 | ||||||||||
| GSTP1 I105V | AA (%) | AG (%) | GG (%) | Any G (%) | P* | |||||
| Subject group (n = 220) | 109 (50) | 87 (40) | 24 (11) | |||||||
| Allele frequency | 0.693 | 0.307 | ||||||||
| CRC+ (n = 118) | 56 (47) | 49 (42) | 13 (11) | 62 (53) | 0.80 | |||||
| CRC− (n = 100) | 52 (52) | 38 (38) | 10 (10) | 48 (48) | ||||||
| OR, 0.83;† 95% CI, 0.49-01.42; P = 0.59 | ||||||||||
| NAT2 T341C | TT (%) | TC (%) | CC (%) | Any C (%) | P* | |||||
| Subject group (n = 219) | 71 (32) | 105 (48) | 43 (20) | |||||||
| Allele frequency | 0.564 | 0.436 | ||||||||
| CRC+ (n = 117) | 33 (28) | 61 (52) | 23 (20) | 84 (72) | 0.33 | |||||
| CRC− (n = 100) | 37 (37) | 43 (43) | 20 (20) | 63 (63) | ||||||
| OR, 0.67;† 95% CI, 0.38-1.19; P = 0.22 | ||||||||||
| NAT2 C481T | CC (%) | CT (%) | TT (%) | Any T (%) | P* | |||||
| Subject group (n = 218) | 76 (35) | 103 (47) | 39 (18) | |||||||
| Allele frequency | 0.585 | 0.415 | ||||||||
| CRC+ (n = 117) | 36 (31) | 59 (50) | 22 (19) | 81 (69) | 0.41 | |||||
| CRC− (n = 99) | 39 (39) | 43 (43) | 17 (17) | 60 (60) | ||||||
| OR, 0.68;† 95% CI, 0.39-1.20; P = 0.24 | ||||||||||
| NAT2 G590A | GG (%) | GA (%) | AA (%) | Any A (%) | P* | |||||
| Subject group (n = 219) | 126 (58) | 77 (35) | 16 (7) | |||||||
| Allele frequency | 0.751 | 0.249 | ||||||||
| CRC+ (n = 118) | 72 (61) | 38 (32) | 8 (7) | 46 (39) | 0.63 | |||||
| CRC− (n = 99) | 54 (55) | 37 (37) | 8 (8) | 45 (45) | ||||||
| OR, 1.30;† 95% CI, 0.76-2.24; P = 0.41 | ||||||||||
| NAT2 G857A | GG (%) | GA (%) | AA (%) | Any A (%) | P* | |||||
| Subject group (n = 218) | 212 (97) | 5 (2) | 1 (0) | |||||||
| Allele frequency | 0.984 | 0.016 | ||||||||
| CRC+ (n = 118) | 115 (97) | 2 (2) | 1 (1) | 3 (3) | 0.53 | |||||
| CRC− (n = 98) | 95 (97) | 3 (3) | 0 (0) | 3 (3) | ||||||
| OR, 1.30;† 95% CI, 0.24-6.14; P = 0.82 | ||||||||||
| CYP1A1 T3810C . | TT (%) . | TC (%) . | CC (%) . | Any C (%) . | P* . | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Subject group (n = 220) | 187 (85) | 29 (13) | 4 (2) | |||||||
| Allele frequency | 0.916 | 0.084 | ||||||||
| CRC+ (n = 118) | 94 (80) | 20 (17) | 4 (3) | 24 (20) | 0.03 | |||||
| CRC− (n = 100) | 91 (91) | 9 (9) | 0 (0) | 9 (9) | ||||||
| OR, 0.39;† 95% CI, 0.17-0.88; P = 0.03 | ||||||||||
| GSTM1 del | WT (%) | Deletion (%) | Any A (%) | P* | ||||||
| Subject group (n = 220) | 99 (45) | N/A | 121 (55) | |||||||
| Allele frequency | 0.450 | 0.550 | ||||||||
| CRC+ (n = 118) | 53 (45) | N/A | 65 (55) | 65 (55) | 0.99 | |||||
| CRC− (n = 100) | 45 (45) | N/A | 55 (55) | 55 (55) | ||||||
| OR, 0.99;† 95% CI, 0.58-1.70; P = 0.99 | ||||||||||
| GSTT1 del | WT (%) | Deletion (%) | Any A (%) | P* | ||||||
| Subject group (n = 220) | 175 (80) | N/A | 45 (20) | |||||||
| Allele frequency | 0.795 | 0.205 | ||||||||
| CRC+ (n = 118) | 93 (79) | N/A | 25 (21) | 25 (21) | 0.83 | |||||
| CRC− (n = 100) | 80 (80) | N/A | 20 (20) | 20 (20) | ||||||
| OR, 0.93;† 95% CI, 0.48-1.80; P = 0.96 | ||||||||||
| GSTP1 I105V | AA (%) | AG (%) | GG (%) | Any G (%) | P* | |||||
| Subject group (n = 220) | 109 (50) | 87 (40) | 24 (11) | |||||||
| Allele frequency | 0.693 | 0.307 | ||||||||
| CRC+ (n = 118) | 56 (47) | 49 (42) | 13 (11) | 62 (53) | 0.80 | |||||
| CRC− (n = 100) | 52 (52) | 38 (38) | 10 (10) | 48 (48) | ||||||
| OR, 0.83;† 95% CI, 0.49-01.42; P = 0.59 | ||||||||||
| NAT2 T341C | TT (%) | TC (%) | CC (%) | Any C (%) | P* | |||||
| Subject group (n = 219) | 71 (32) | 105 (48) | 43 (20) | |||||||
| Allele frequency | 0.564 | 0.436 | ||||||||
| CRC+ (n = 117) | 33 (28) | 61 (52) | 23 (20) | 84 (72) | 0.33 | |||||
| CRC− (n = 100) | 37 (37) | 43 (43) | 20 (20) | 63 (63) | ||||||
| OR, 0.67;† 95% CI, 0.38-1.19; P = 0.22 | ||||||||||
| NAT2 C481T | CC (%) | CT (%) | TT (%) | Any T (%) | P* | |||||
| Subject group (n = 218) | 76 (35) | 103 (47) | 39 (18) | |||||||
| Allele frequency | 0.585 | 0.415 | ||||||||
| CRC+ (n = 117) | 36 (31) | 59 (50) | 22 (19) | 81 (69) | 0.41 | |||||
| CRC− (n = 99) | 39 (39) | 43 (43) | 17 (17) | 60 (60) | ||||||
| OR, 0.68;† 95% CI, 0.39-1.20; P = 0.24 | ||||||||||
| NAT2 G590A | GG (%) | GA (%) | AA (%) | Any A (%) | P* | |||||
| Subject group (n = 219) | 126 (58) | 77 (35) | 16 (7) | |||||||
| Allele frequency | 0.751 | 0.249 | ||||||||
| CRC+ (n = 118) | 72 (61) | 38 (32) | 8 (7) | 46 (39) | 0.63 | |||||
| CRC− (n = 99) | 54 (55) | 37 (37) | 8 (8) | 45 (45) | ||||||
| OR, 1.30;† 95% CI, 0.76-2.24; P = 0.41 | ||||||||||
| NAT2 G857A | GG (%) | GA (%) | AA (%) | Any A (%) | P* | |||||
| Subject group (n = 218) | 212 (97) | 5 (2) | 1 (0) | |||||||
| Allele frequency | 0.984 | 0.016 | ||||||||
| CRC+ (n = 118) | 115 (97) | 2 (2) | 1 (1) | 3 (3) | 0.53 | |||||
| CRC− (n = 98) | 95 (97) | 3 (3) | 0 (0) | 3 (3) | ||||||
| OR, 1.30;† 95% CI, 0.24-6.14; P = 0.82 | ||||||||||