Skip to Main Content
Table 1.

Reproducibility and linearity of reverse-protein microarray data

XPAXPF
Sample 1            
    Total protein (μg/μL)  0.96 0.48 0.24 0.12 0.06 0.96 0.48 0.24 0.12 0.06 
    Signal intensity (arbitrary units) R1* 51,787 18,817 8,025 4,641 2,375 36,356 16,923 4,481 2,369 436 
 R2 54,704 15,702 6,130 3,418 1,797 32,925 16,802 5,574 2,119 476 
 R3 49,131 15,106 5,488 3,263 1,461 30,030 16,255 4,969 2,243 553 
    Mean (SD)†  51,874 (2,788) 16,542 (1,993) 6,548 (1,319) 3,774 (755) 1,878 (462) 33,104 (3,167) 16,660 (356) 5,008 (548) 2,244 (125) 488 (60) 
    CV (%)  5.4 12.1 20.2 20.1 24.6 9.6 2.1 10.9 5.6 12.2 
Sample 2            
    Total protein (μg/μL)  1 0.5 0.25 0.125 0.0625 1 0.5 0.25 0.125 0.0625 
    Signal intensity (arbitrary units) R1 46,645 18,305 5,724 2,713 1,354 35,249 15,373 4,331 1,054 317 
 R2 43,944 13,908 5,901 2,513 1,316 37,172 16,418 4,774 1,058 294 
 R3 38,014 14,368 5,593 2,118 839 33,349 14,328 4,826 1,473 258 
    Mean (SD)†  42,868 (4,415) 15,527 (2,417) 5,739 (155) 2,448 (303) 1,170 (287) 35,257 (1,912) 15,373 (1,045) 4,644 (272) 1,195 (241) 290 (30) 
    CV (%)  10.3 15.6 2.7 12.4 24.5 5.4 6.8 5.9 20.2 10.3 
Sample 3            
    Total protein (μg/μL)  0.88 0.44 0.22 0.11 0.055 0.88 0.44 0.22 0.11 0.055 
    Signal intensity (arbitrary units) R1 58,360 21,799 8,297 4,644 2,511 33,940 17,236 4,507 1,316 374 
 R2 58,558 18,709 5,318 3,561 1,947 33,720 15,228 3,769 1,327 385 
 R3 51,531 17,762 5,931 3,306 2,201 32,877 13,946 3,776 1,193 321 
    Mean (SD)†  56,150 (4,001) 19,423 (2,111) 6,515 (1,573) 3,837 (710) 2,220 (283) 33,512 (561) 15,470 (1,658) 4,017 (424) 1,279 (74) 360 (34) 
    CV (%)  7.1 10.9 24.2 18.5 12.7 1.7 10.7 10.6 5.8 9.5 
Sample 4            
    Total protein (μg/μL)  0.84 0.42 0.21 0.105 0.0525 0.84 0.42 0.21 0.105 0.0525 
    Signal intensity (arbitrary units) R1 60,447 22,560 9,560 4,214 2,130 35,167 18,616 6,519 2,119 538 
 R2 59,055 16,333 7,948 3,163 1,918 34,935 18,613 6,584 1,865 538 
 R3 52,017 15,913 6,862 2,828 1,314 34,615 18,931 6,259 2,428 680 
    Mean (SD)†  57,173 (4,519) 18,269 (3,722) 8,123 (1,358) 3,402 (723) 1,787 (423) 34,906 (277) 18,720 (182) 6,454 (172) 2,137 (282) 585 (82) 
    CV (%)  7.9 20.4 16.7 21.3 23.7 0.8 1.0 2.7 13.2 14.0 
XPAXPF
Sample 1            
    Total protein (μg/μL)  0.96 0.48 0.24 0.12 0.06 0.96 0.48 0.24 0.12 0.06 
    Signal intensity (arbitrary units) R1* 51,787 18,817 8,025 4,641 2,375 36,356 16,923 4,481 2,369 436 
 R2 54,704 15,702 6,130 3,418 1,797 32,925 16,802 5,574 2,119 476 
 R3 49,131 15,106 5,488 3,263 1,461 30,030 16,255 4,969 2,243 553 
    Mean (SD)†  51,874 (2,788) 16,542 (1,993) 6,548 (1,319) 3,774 (755) 1,878 (462) 33,104 (3,167) 16,660 (356) 5,008 (548) 2,244 (125) 488 (60) 
    CV (%)  5.4 12.1 20.2 20.1 24.6 9.6 2.1 10.9 5.6 12.2 
Sample 2            
    Total protein (μg/μL)  1 0.5 0.25 0.125 0.0625 1 0.5 0.25 0.125 0.0625 
    Signal intensity (arbitrary units) R1 46,645 18,305 5,724 2,713 1,354 35,249 15,373 4,331 1,054 317 
 R2 43,944 13,908 5,901 2,513 1,316 37,172 16,418 4,774 1,058 294 
 R3 38,014 14,368 5,593 2,118 839 33,349 14,328 4,826 1,473 258 
    Mean (SD)†  42,868 (4,415) 15,527 (2,417) 5,739 (155) 2,448 (303) 1,170 (287) 35,257 (1,912) 15,373 (1,045) 4,644 (272) 1,195 (241) 290 (30) 
    CV (%)  10.3 15.6 2.7 12.4 24.5 5.4 6.8 5.9 20.2 10.3 
Sample 3            
    Total protein (μg/μL)  0.88 0.44 0.22 0.11 0.055 0.88 0.44 0.22 0.11 0.055 
    Signal intensity (arbitrary units) R1 58,360 21,799 8,297 4,644 2,511 33,940 17,236 4,507 1,316 374 
 R2 58,558 18,709 5,318 3,561 1,947 33,720 15,228 3,769 1,327 385 
 R3 51,531 17,762 5,931 3,306 2,201 32,877 13,946 3,776 1,193 321 
    Mean (SD)†  56,150 (4,001) 19,423 (2,111) 6,515 (1,573) 3,837 (710) 2,220 (283) 33,512 (561) 15,470 (1,658) 4,017 (424) 1,279 (74) 360 (34) 
    CV (%)  7.1 10.9 24.2 18.5 12.7 1.7 10.7 10.6 5.8 9.5 
Sample 4            
    Total protein (μg/μL)  0.84 0.42 0.21 0.105 0.0525 0.84 0.42 0.21 0.105 0.0525 
    Signal intensity (arbitrary units) R1 60,447 22,560 9,560 4,214 2,130 35,167 18,616 6,519 2,119 538 
 R2 59,055 16,333 7,948 3,163 1,918 34,935 18,613 6,584 1,865 538 
 R3 52,017 15,913 6,862 2,828 1,314 34,615 18,931 6,259 2,428 680 
    Mean (SD)†  57,173 (4,519) 18,269 (3,722) 8,123 (1,358) 3,402 (723) 1,787 (423) 34,906 (277) 18,720 (182) 6,454 (172) 2,137 (282) 585 (82) 
    CV (%)  7.9 20.4 16.7 21.3 23.7 0.8 1.0 2.7 13.2 14.0 
*

R1-3, repeats 1 to 3.

†

Standard deviation of the three experiments.

View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal
This site uses cookies. By continuing to use our website, you are agreeing to our privacy policy.
Accept