Skip to Main Content
Table 5.

Comparison of observed and expected frequencies in two genotype infections

Pattern of coinfectionOverall, observed (expected)Overall [O-E]*HIV (−) Observed (expected)HIV (−) [O-E]*HIV (+) Observed (expected)HIV (+) [O-E]*≤25 years Observed (expected)≤25 [O-E]*>25 years observed (expected)>25 [O-E]*
A3-A3 0 (0.43) 0.43 0 (0.17) 0.17 0 (0.29) 0.29 0 (0.11) 0.11 0 (0.32) 0.32 
A5-A5 1 (0.40) 0.60 1 (0.21) 0.79 0 (0.15) 0.15 1 (0.78) 0.78 0 (0.16) 0.16 
A6-A6 2 (1.04) 0.96 1 (0.44) 0.56 1 (0.65) 0.35 1 (0.42) 0.58 1 (0.56) 0.44 
A7-A7 6 (4.63) 1.37 5 (2.95) 2.05 1 (1.64) 0.64 4 (2.44) 1.56 2 (2.15) 0.15 
A9-A9 14 (12.68) 1.31 12 (9.58) 2.42 2 (4.24) 2.24 11 (8.00) 3.00 3 (5.04) 2.04 
A10-A10 0 (0.27) 0.27 0 (0.12) 0.12 0 (0.15) 0.15 0 (0.09) 0.09 0 (0.15) 0.15 
A3-A5 2 (1.80) 0.20 0 (0.89) 0.89 2 (0.91) 1.09 0 (0.69) 0.69 2 (1.03) 0.97 
A3-A6 3 (2.56) 0.44 0 (1.0) 1.00 3 (1.81) 1.19 0 (0.78) 0.78 3 (1.81) 1.19 
A3-A7 2 (4.70) 2.70 1 (2.3) 1.3 1 (2.45) 1.45 0 (1.69) 1.69 2 (2.92) 0.92 
A3-A9 6 (7.79) 1.79 3 (4.15) 1.15 3 (3.80) 0.80 0 (3.08) 3.08 6 (4.41) 1.59 
A3-A10 1 (1.28) 0.28 0 (0.54) 0.54 1 (0.81) 0.19 0 (0.39) 0.39 1 (0.89) 0.11 
A5-A6 1 (2.45) 1.45 0 (1.27) 1.27 1 (1.17) 0.17 1 (1.18) 0.18 0 (1.24) 1.24 
A5-A7 6 (4.50) 1.50 4 (2.90) 1.10 2 (1.58) 0.42 4 (2.54) 1.46 2 (2.0) 0.00 
A5-A9 10 (7.45) 2.55 9 (5.25) 3.75 1 (2.45) 1.45 8 (4.62) 3.37 2 (3.01) 1.01 
A5-A10 0 (1.23) 1.23 0 (0.68) 0.68 0 (0.52) 0.52 0 (0.59) 0.59 0 (0.61) 0.61 
A6-A7 8 (6.40) 1.60 3 (3.29) 0.29 5 (3.16) 1.83 3 (2.87) 0.13 5 (3.50) 1.50 
A6-A9 7 (10.60) 3.60 4 (5.94) 1.94 3 (4.90) 1.90 4 (5.24) 1.24 3 (5.27) 2.27 
A6-A10 6 (1.75) 4.25 3 (0.77) 2.23 3 (1.05) 1.95 0 (0.67) 0.67 6 (1.06) 4.93 
A7-A9 22 (19.48) 2.52 14 (13.54) 0.46 8 (6.62) 1.37 12 (11.25) 0.74 10 (8.5) 1.5 
A7-A10 1 (3.20) 2.20 0 (1.76) 1.76 1 (1.42) 0.42 1 (1.43) 0.43 0 (1.71) 1.71 
A9-A10 2 (5.30) 3.30 1 (3.18) 2.18 1 (2.20) 1.20 1 (2.62) 1.62 1 (2.58) 1.58 
Total 100 (100)  61 (61)  39 (39)  51 (51)  49 (49)  
Deviation score  34.56  26.61  19.80  23.21  24.41 
Exact P†  0.29  0.23  0.72  0.33  0.29 
Pattern of coinfectionOverall, observed (expected)Overall [O-E]*HIV (−) Observed (expected)HIV (−) [O-E]*HIV (+) Observed (expected)HIV (+) [O-E]*≤25 years Observed (expected)≤25 [O-E]*>25 years observed (expected)>25 [O-E]*
A3-A3 0 (0.43) 0.43 0 (0.17) 0.17 0 (0.29) 0.29 0 (0.11) 0.11 0 (0.32) 0.32 
A5-A5 1 (0.40) 0.60 1 (0.21) 0.79 0 (0.15) 0.15 1 (0.78) 0.78 0 (0.16) 0.16 
A6-A6 2 (1.04) 0.96 1 (0.44) 0.56 1 (0.65) 0.35 1 (0.42) 0.58 1 (0.56) 0.44 
A7-A7 6 (4.63) 1.37 5 (2.95) 2.05 1 (1.64) 0.64 4 (2.44) 1.56 2 (2.15) 0.15 
A9-A9 14 (12.68) 1.31 12 (9.58) 2.42 2 (4.24) 2.24 11 (8.00) 3.00 3 (5.04) 2.04 
A10-A10 0 (0.27) 0.27 0 (0.12) 0.12 0 (0.15) 0.15 0 (0.09) 0.09 0 (0.15) 0.15 
A3-A5 2 (1.80) 0.20 0 (0.89) 0.89 2 (0.91) 1.09 0 (0.69) 0.69 2 (1.03) 0.97 
A3-A6 3 (2.56) 0.44 0 (1.0) 1.00 3 (1.81) 1.19 0 (0.78) 0.78 3 (1.81) 1.19 
A3-A7 2 (4.70) 2.70 1 (2.3) 1.3 1 (2.45) 1.45 0 (1.69) 1.69 2 (2.92) 0.92 
A3-A9 6 (7.79) 1.79 3 (4.15) 1.15 3 (3.80) 0.80 0 (3.08) 3.08 6 (4.41) 1.59 
A3-A10 1 (1.28) 0.28 0 (0.54) 0.54 1 (0.81) 0.19 0 (0.39) 0.39 1 (0.89) 0.11 
A5-A6 1 (2.45) 1.45 0 (1.27) 1.27 1 (1.17) 0.17 1 (1.18) 0.18 0 (1.24) 1.24 
A5-A7 6 (4.50) 1.50 4 (2.90) 1.10 2 (1.58) 0.42 4 (2.54) 1.46 2 (2.0) 0.00 
A5-A9 10 (7.45) 2.55 9 (5.25) 3.75 1 (2.45) 1.45 8 (4.62) 3.37 2 (3.01) 1.01 
A5-A10 0 (1.23) 1.23 0 (0.68) 0.68 0 (0.52) 0.52 0 (0.59) 0.59 0 (0.61) 0.61 
A6-A7 8 (6.40) 1.60 3 (3.29) 0.29 5 (3.16) 1.83 3 (2.87) 0.13 5 (3.50) 1.50 
A6-A9 7 (10.60) 3.60 4 (5.94) 1.94 3 (4.90) 1.90 4 (5.24) 1.24 3 (5.27) 2.27 
A6-A10 6 (1.75) 4.25 3 (0.77) 2.23 3 (1.05) 1.95 0 (0.67) 0.67 6 (1.06) 4.93 
A7-A9 22 (19.48) 2.52 14 (13.54) 0.46 8 (6.62) 1.37 12 (11.25) 0.74 10 (8.5) 1.5 
A7-A10 1 (3.20) 2.20 0 (1.76) 1.76 1 (1.42) 0.42 1 (1.43) 0.43 0 (1.71) 1.71 
A9-A10 2 (5.30) 3.30 1 (3.18) 2.18 1 (2.20) 1.20 1 (2.62) 1.62 1 (2.58) 1.58 
Total 100 (100)  61 (61)  39 (39)  51 (51)  49 (49)  
Deviation score  34.56  26.61  19.80  23.21  24.41 
Exact P†  0.29  0.23  0.72  0.33  0.29 
*

Absolute difference between observed and expected frequencies.

†

Exact P calculated from 10,000 Monte Carlo simulations.

View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal
This site uses cookies. By continuing to use our website, you are agreeing to our privacy policy.
Accept